Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPAT3Q53EU6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPAT3Q53EU6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPAT3Q53EU6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms