Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXO43Q4G163 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO43Q4G163 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO43Q4G163 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO43Q4G163 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms