Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1BQ3KR37 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1BQ3KR37 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1BQ3KR37 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms