Protein–RNA interactions for Protein: Q32NB8

PGS1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1Q32NB8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGS1Q32NB8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PGS1Q32NB8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGS1Q32NB8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms