Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UVSSAQ2YD98 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UVSSAQ2YD98 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
UVSSAQ2YD98 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms