Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RTL8BQ17RB0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RTL8BQ17RB0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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