Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN21Q16825 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPN21Q16825 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPN21Q16825 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN21Q16825 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
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