Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTGISQ16647 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PTGISQ16647 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTGISQ16647 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTGISQ16647 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTGISQ16647 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGISQ16647 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms