Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGCAQ16586 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCAQ16586 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCAQ16586 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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