Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXT1Q16394 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EXT1Q16394 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms