Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TGIF1Q15583 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGIF1Q15583 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TGIF1Q15583 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGIF1Q15583 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGIF1Q15583 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGIF1Q15583 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGIF1Q15583 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGIF1Q15583 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGIF1Q15583 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGIF1Q15583 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGIF1Q15583 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TGIF1Q15583 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGIF1Q15583 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGIF1Q15583 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TGIF1Q15583 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGIF1Q15583 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
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