Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF4Q15306 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF4Q15306 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF4Q15306 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF4Q15306 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF4Q15306 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF4Q15306 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF4Q15306 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF4Q15306 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF4Q15306 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF4Q15306 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF4Q15306 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF4Q15306 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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