Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDK1Q15118 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDK1Q15118 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDK1Q15118 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDK1Q15118 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDK1Q15118 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDK1Q15118 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDK1Q15118 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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