Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCF4Q15080 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCF4Q15080 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCF4Q15080 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCF4Q15080 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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