Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.57■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC42.56■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.55■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
EEA1Q15075 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
EEA1Q15075 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
EEA1Q15075 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
EEA1Q15075 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
EEA1Q15075 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
EEA1Q15075 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
EEA1Q15075 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
EEA1Q15075 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC42.33■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC42.33■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
EEA1Q15075 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
EEA1Q15075 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms