Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF1Q14990 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF1Q14990 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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