Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3AQ14563 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3AQ14563 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3AQ14563 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3AQ14563 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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