Protein–RNA interactions for Protein: Q13571

LAPTM5, Lysosomal-associated transmembrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM5Q13571 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAPTM5Q13571 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAPTM5Q13571 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAPTM5Q13571 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAPTM5Q13571 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAPTM5Q13571 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAPTM5Q13571 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAPTM5Q13571 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAPTM5Q13571 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAPTM5Q13571 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAPTM5Q13571 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAPTM5Q13571 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAPTM5Q13571 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms