Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNTA1Q13424 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNTA1Q13424 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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