Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
AP3B2Q13367 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AP3B2Q13367 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
AP3B2Q13367 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
AP3B2Q13367 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AP3B2Q13367 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AP3B2Q13367 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms