Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3Q13114 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3Q13114 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAF3Q13114 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
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