Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM32Q13049 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM32Q13049 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM32Q13049 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM32Q13049 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM32Q13049 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM32Q13049 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM32Q13049 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM32Q13049 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM32Q13049 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM32Q13049 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM32Q13049 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM32Q13049 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM32Q13049 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM32Q13049 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM32Q13049 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM32Q13049 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM32Q13049 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM32Q13049 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM32Q13049 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM32Q13049 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM32Q13049 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
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