Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC45.02■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
PRDM2Q13029 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
PRDM2Q13029 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
PRDM2Q13029 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
PRDM2Q13029 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
PRDM2Q13029 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
PRDM2Q13029 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC44.95■■■■■ 4.79
PRDM2Q13029 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
PRDM2Q13029 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
PRDM2Q13029 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
PRDM2Q13029 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
PRDM2Q13029 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
PRDM2Q13029 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
PRDM2Q13029 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
PRDM2Q13029 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
PRDM2Q13029 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
PRDM2Q13029 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
PRDM2Q13029 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
PRDM2Q13029 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
PRDM2Q13029 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
PRDM2Q13029 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
PRDM2Q13029 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
PRDM2Q13029 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
PRDM2Q13029 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
PRDM2Q13029 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC44.81■■■■■ 4.76
PRDM2Q13029 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
PRDM2Q13029 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
PRDM2Q13029 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
PRDM2Q13029 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC44.77■■■■■ 4.76
PRDM2Q13029 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
PRDM2Q13029 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
PRDM2Q13029 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC44.7■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
PRDM2Q13029 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
PRDM2Q13029 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
PRDM2Q13029 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
PRDM2Q13029 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
PRDM2Q13029 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
PRDM2Q13029 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
PRDM2Q13029 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
PRDM2Q13029 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
PRDM2Q13029 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
PRDM2Q13029 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
PRDM2Q13029 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC44.6■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.73
PRDM2Q13029 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
PRDM2Q13029 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
PRDM2Q13029 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
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