Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 HXT13YEL069C 1695 nt7.38□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 YEL023CYEL023C 2049 nt7.37□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 NIF3YGL221C 867 nt7.36□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 IMO32YGR031W 1029 nt7.36□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 SLG1YOR008C 1137 nt7.36□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 APS2YJR058C 444 nt7.35□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 MET1YKR069W 1782 nt7.34□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 LYS20YDL182W 1287 nt7.34□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 ADE8YDR408C 645 nt7.34□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 AAC3YBR085W 924 nt7.33□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 MET13YGL125W 1803 nt7.33□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 TIF3YPR163C 1311 nt7.32□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 SGF73YGL066W 1974 nt7.32□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 SBP1YHL034C 885 nt7.32□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 YNL140CYNL140C 570 nt7.32□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 SPS100YHR139C 981 nt7.31□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 STF1YDL130W-A 261 nt7.3□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 OPI3YJR073C 621 nt7.3□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 SWT21YNL187W 1074 nt7.3□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.29□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 GUT1YHL032C 2130 nt7.28□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 IGD1YFR017C 588 nt7.28□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.28□□□□□ -1.24
RTR2Q12378 YER137CYER137C 447 nt7.27□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 CMK2YOL016C 1344 nt7.26□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 YKL053WYKL053W 375 nt7.25□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 TVP23YDR084C 600 nt7.24□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 YJL009WYJL009W 327 nt7.24□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 APT1YML022W 564 nt7.24□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 RIB1YBL033C 1038 nt7.24□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 FCP1YMR277W 2199 nt7.24□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 BNA3YJL060W 1335 nt7.24□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 RSC9YML127W 1746 nt7.24□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 YIA6YIL006W 1122 nt7.23□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 TMS1YDR105C 1422 nt7.23□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 CDC13YDL220C 2775 nt7.23□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 MRN1YPL184C 1839 nt7.22□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 YBL111CYBL111C 2004 nt7.22□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 YCP4YCR004C 744 nt7.22□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 INM1YHR046C 888 nt7.22□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 YLR030WYLR030W 792 nt7.22□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 CDD1YLR245C 429 nt7.22□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 ABZ2YMR289W 1125 nt7.22□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 ADH6YMR318C 1083 nt7.22□□□□□ -1.25
RTR2Q12378 RPL12BYDR418W 498 nt7.21□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 IPL1YPL209C 1104 nt7.21□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 SAN1YDR143C 1833 nt7.2□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 GLY1YEL046C 1164 nt7.2□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 NAS2YIL007C 663 nt7.2□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 KRE1YNL322C 942 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 BAP3YDR046C 1815 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 INO1YJL153C 1602 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 YKR018CYKR018C 2178 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 MAS1YLR163C 1389 nt7.19□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 LRO1YNR008W 1986 nt7.18□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 THP3YPR045C 1413 nt7.18□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 MEP1YGR121C 1479 nt7.17□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 TGL5YOR081C 2250 nt7.17□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 YCR025CYCR025C 411 nt7.17□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 SOD2YHR008C 702 nt7.17□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 CKI1YLR133W 1749 nt7.17□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 YCR061WYCR061W 1896 nt7.17□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 PRB1YEL060C 1908 nt7.16□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 KTR4YBR199W 1395 nt7.16□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 BUD31YCR063W 474 nt7.15□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 FSH2YMR222C 672 nt7.15□□□□□ -1.26
RTR2Q12378 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.14□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 FLX1YIL134W 936 nt7.14□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 YBR056WYBR056W 1506 nt7.14□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 MAL31YBR298C 1845 nt7.13□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 SPE2YOL052C 1191 nt7.13□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 HEL1YKR017C 1656 nt7.12□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 GAS1YMR307W 1680 nt7.12□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 PMT1YDL095W 2454 nt7.11□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 ENO2YHR174W 1314 nt7.11□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 SWM1YDR260C 513 nt7.11□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 TDA4YJR116W 840 nt7.11□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 PPS1YBR276C 2424 nt7.11□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 TOD6YBL054W 1578 nt7.11□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 AMF1YOR378W 1548 nt7.11□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 PHB2YGR231C 933 nt7.1□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 PTC6YCR079W 1329 nt7.09□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.09□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 SEC24YIL109C 2781 nt7.09□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 EDC3YEL015W 1656 nt7.09□□□□□ -1.27
RTR2Q12378 TRR1YDR353W 960 nt7.08□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 GNA1YFL017C 480 nt7.08□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 TPC1YGR096W 945 nt7.08□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 ADH3YMR083W 1128 nt7.08□□□□□ -1.28
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