Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C2orf54Q08AI8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C2orf54Q08AI8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
C2orf54Q08AI8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C2orf54Q08AI8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C2orf54Q08AI8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C2orf54Q08AI8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C2orf54Q08AI8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C2orf54Q08AI8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C2orf54Q08AI8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C2orf54Q08AI8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C2orf54Q08AI8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C2orf54Q08AI8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C2orf54Q08AI8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C2orf54Q08AI8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
C2orf54Q08AI8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C2orf54Q08AI8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms