Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC38A11Q08AI6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC38A11Q08AI6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms