Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PPARAQ07869 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPARAQ07869 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
PPARAQ07869 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PPARAQ07869 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PPARAQ07869 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PPARAQ07869 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
PPARAQ07869 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms