Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTK2Q05397 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PTK2Q05397 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTK2Q05397 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTK2Q05397 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTK2Q05397 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTK2Q05397 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTK2Q05397 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTK2Q05397 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTK2Q05397 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTK2Q05397 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTK2Q05397 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PTK2Q05397 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTK2Q05397 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTK2Q05397 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTK2Q05397 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTK2Q05397 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTK2Q05397 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTK2Q05397 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTK2Q05397 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTK2Q05397 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTK2Q05397 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTK2Q05397 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTK2Q05397 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTK2Q05397 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTK2Q05397 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTK2Q05397 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms