Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NHLH2Q02577 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NHLH2Q02577 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NHLH2Q02577 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms