Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTBSQ01459 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTBSQ01459 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTBSQ01459 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTBSQ01459 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTBSQ01459 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTBSQ01459 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTBSQ01459 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTBSQ01459 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTBSQ01459 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTBSQ01459 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTBSQ01459 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTBSQ01459 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTBSQ01459 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTBSQ01459 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTBSQ01459 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTBSQ01459 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTBSQ01459 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms