Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXO4P98177 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXO4P98177 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXO4P98177 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXO4P98177 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXO4P98177 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXO4P98177 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXO4P98177 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXO4P98177 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXO4P98177 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXO4P98177 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FOXO4P98177 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXO4P98177 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FOXO4P98177 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXO4P98177 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXO4P98177 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXO4P98177 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXO4P98177 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms