Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNB1P98172 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EFNB1P98172 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFNB1P98172 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms