Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPCAP84074 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPCAP84074 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPCAP84074 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPCAP84074 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPCAP84074 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPCAP84074 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HPCAP84074 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPCAP84074 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPCAP84074 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPCAP84074 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPCAP84074 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPCAP84074 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPCAP84074 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPCAP84074 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPCAP84074 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAP84074 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAP84074 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAP84074 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAP84074 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAP84074 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAP84074 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAP84074 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAP84074 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAP84074 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAP84074 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAP84074 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAP84074 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAP84074 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HPCAP84074 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPCAP84074 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAP84074 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAP84074 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAP84074 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAP84074 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAP84074 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAP84074 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAP84074 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAP84074 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAP84074 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAP84074 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAP84074 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPCAP84074 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPCAP84074 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPCAP84074 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAP84074 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAP84074 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAP84074 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAP84074 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAP84074 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAP84074 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAP84074 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAP84074 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAP84074 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAP84074 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAP84074 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAP84074 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAP84074 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAP84074 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAP84074 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAP84074 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAP84074 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAP84074 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAP84074 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAP84074 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAP84074 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAP84074 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAP84074 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAP84074 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAP84074 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPCAP84074 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPCAP84074 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPCAP84074 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPCAP84074 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPCAP84074 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HPCAP84074 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPCAP84074 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPCAP84074 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPCAP84074 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPCAP84074 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPCAP84074 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPCAP84074 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPCAP84074 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPCAP84074 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPCAP84074 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPCAP84074 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPCAP84074 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPCAP84074 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HPCAP84074 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPCAP84074 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPCAP84074 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPCAP84074 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPCAP84074 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAP84074 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAP84074 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAP84074 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAP84074 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAP84074 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAP84074 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAP84074 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms