Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HBA1P69905 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HBA1P69905 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HBA1P69905 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HBA1P69905 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HBA1P69905 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HBA1P69905 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HBA1P69905 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HBA1P69905 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HBA1P69905 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HBA1P69905 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HBA1P69905 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HBA1P69905 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HBA1P69905 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HBA1P69905 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HBA1P69905 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HBA1P69905 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HBA1P69905 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HBA1P69905 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HBA1P69905 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HBA1P69905 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HBA1P69905 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HBA1P69905 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HBA1P69905 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HBA1P69905 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HBA1P69905 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HBA1P69905 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HBA1P69905 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HBA1P69905 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HBA1P69905 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HBA1P69905 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HBA1P69905 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HBA1P69905 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HBA1P69905 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HBA1P69905 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HBA1P69905 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HBA1P69905 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HBA1P69905 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HBA1P69905 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HBA1P69905 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HBA1P69905 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HBA1P69905 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HBA1P69905 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HBA1P69905 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HBA1P69905 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HBA1P69905 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HBA1P69905 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HBA1P69905 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HBA1P69905 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HBA1P69905 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HBA1P69905 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HBA1P69905 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HBA1P69905 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HBA1P69905 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HBA1P69905 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HBA1P69905 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HBA1P69905 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HBA1P69905 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HBA1P69905 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HBA1P69905 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HBA1P69905 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HBA1P69905 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HBA1P69905 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HBA1P69905 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HBA1P69905 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HBA1P69905 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HBA1P69905 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HBA1P69905 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HBA1P69905 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HBA1P69905 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HBA1P69905 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HBA1P69905 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HBA1P69905 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HBA1P69905 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HBA1P69905 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HBA1P69905 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HBA1P69905 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HBA1P69905 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HBA1P69905 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HBA1P69905 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HBA1P69905 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HBA1P69905 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HBA1P69905 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HBA1P69905 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HBA1P69905 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HBA1P69905 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HBA1P69905 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HBA1P69905 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HBA1P69905 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HBA1P69905 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HBA1P69905 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HBA1P69905 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HBA1P69905 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HBA1P69905 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HBA1P69905 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HBA1P69905 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HBA1P69905 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HBA1P69905 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HBA1P69905 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HBA1P69905 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms