Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P61574 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERVK_113P61574 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms