Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GSDMDP57764 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GSDMDP57764 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSDMDP57764 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSDMDP57764 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSDMDP57764 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSDMDP57764 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSDMDP57764 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSDMDP57764 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GSDMDP57764 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GSDMDP57764 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GSDMDP57764 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GSDMDP57764 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GSDMDP57764 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GSDMDP57764 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GSDMDP57764 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSDMDP57764 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSDMDP57764 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms