Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RIPK4P57078 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RIPK4P57078 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RIPK4P57078 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
RIPK4P57078 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RIPK4P57078 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RIPK4P57078 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RIPK4P57078 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RIPK4P57078 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RIPK4P57078 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RIPK4P57078 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RIPK4P57078 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RIPK4P57078 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RIPK4P57078 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RIPK4P57078 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RIPK4P57078 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RIPK4P57078 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RIPK4P57078 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RIPK4P57078 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
RIPK4P57078 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RIPK4P57078 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RIPK4P57078 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
RIPK4P57078 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RIPK4P57078 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RIPK4P57078 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RIPK4P57078 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RIPK4P57078 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RIPK4P57078 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIPK4P57078 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIPK4P57078 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms