Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC13P55735 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC13P55735 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC13P55735 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC13P55735 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC13P55735 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC13P55735 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC13P55735 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC13P55735 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC13P55735 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC13P55735 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC13P55735 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC13P55735 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC13P55735 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC13P55735 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC13P55735 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC13P55735 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC13P55735 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC13P55735 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC13P55735 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC13P55735 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC13P55735 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC13P55735 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC13P55735 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC13P55735 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC13P55735 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC13P55735 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC13P55735 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC13P55735 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC13P55735 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC13P55735 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC13P55735 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC13P55735 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC13P55735 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC13P55735 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC13P55735 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC13P55735 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC13P55735 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC13P55735 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC13P55735 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC13P55735 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC13P55735 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC13P55735 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC13P55735 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC13P55735 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC13P55735 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC13P55735 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC13P55735 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC13P55735 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC13P55735 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC13P55735 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC13P55735 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC13P55735 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC13P55735 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC13P55735 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC13P55735 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC13P55735 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC13P55735 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC13P55735 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC13P55735 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEC13P55735 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC13P55735 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC13P55735 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC13P55735 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC13P55735 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC13P55735 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC13P55735 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC13P55735 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC13P55735 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC13P55735 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC13P55735 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC13P55735 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC13P55735 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC13P55735 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC13P55735 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC13P55735 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC13P55735 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC13P55735 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC13P55735 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC13P55735 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC13P55735 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC13P55735 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC13P55735 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC13P55735 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC13P55735 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC13P55735 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC13P55735 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC13P55735 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC13P55735 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC13P55735 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC13P55735 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC13P55735 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC13P55735 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC13P55735 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC13P55735 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC13P55735 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC13P55735 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC13P55735 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC13P55735 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC13P55735 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.9 ms