Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP6P55212 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP6P55212 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP6P55212 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP6P55212 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP6P55212 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP6P55212 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP6P55212 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP6P55212 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP6P55212 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP6P55212 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP6P55212 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP6P55212 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP6P55212 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP6P55212 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP6P55212 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP6P55212 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP6P55212 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP6P55212 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP6P55212 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP6P55212 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP6P55212 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP6P55212 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP6P55212 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP6P55212 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP6P55212 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP6P55212 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP6P55212 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP6P55212 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP6P55212 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP6P55212 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP6P55212 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP6P55212 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP6P55212 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP6P55212 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP6P55212 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP6P55212 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP6P55212 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP6P55212 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP6P55212 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP6P55212 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP6P55212 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP6P55212 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP6P55212 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP6P55212 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP6P55212 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP6P55212 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP6P55212 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP6P55212 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP6P55212 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP6P55212 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP6P55212 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP6P55212 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP6P55212 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP6P55212 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP6P55212 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP6P55212 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP6P55212 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP6P55212 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP6P55212 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP6P55212 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP6P55212 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP6P55212 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP6P55212 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP6P55212 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP6P55212 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP6P55212 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP6P55212 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP6P55212 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP6P55212 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP6P55212 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP6P55212 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP6P55212 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP6P55212 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP6P55212 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP6P55212 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP6P55212 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP6P55212 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP6P55212 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP6P55212 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP6P55212 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP6P55212 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP6P55212 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP6P55212 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP6P55212 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP6P55212 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP6P55212 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP6P55212 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP6P55212 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP6P55212 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP6P55212 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP6P55212 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP6P55212 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP6P55212 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP6P55212 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP6P55212 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP6P55212 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP6P55212 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP6P55212 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP6P55212 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms