Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NAP1L1P55209 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NAP1L1P55209 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NAP1L1P55209 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NAP1L1P55209 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms