Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP1B3P54709 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP1B3P54709 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms