Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGGT1BP53609 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PGGT1BP53609 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGGT1BP53609 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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