Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOSBP53539 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOSBP53539 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FOSBP53539 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOSBP53539 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FOSBP53539 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOSBP53539 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOSBP53539 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOSBP53539 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
FOSBP53539 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOSBP53539 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOSBP53539 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOSBP53539 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOSBP53539 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOSBP53539 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOSBP53539 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOSBP53539 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOSBP53539 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOSBP53539 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOSBP53539 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOSBP53539 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOSBP53539 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOSBP53539 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOSBP53539 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOSBP53539 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOSBP53539 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOSBP53539 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOSBP53539 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOSBP53539 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOSBP53539 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOSBP53539 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOSBP53539 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOSBP53539 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
FOSBP53539 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
FOSBP53539 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOSBP53539 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOSBP53539 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOSBP53539 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOSBP53539 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOSBP53539 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOSBP53539 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOSBP53539 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOSBP53539 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOSBP53539 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOSBP53539 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOSBP53539 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOSBP53539 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOSBP53539 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOSBP53539 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
FOSBP53539 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOSBP53539 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOSBP53539 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOSBP53539 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
FOSBP53539 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FOSBP53539 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOSBP53539 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOSBP53539 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOSBP53539 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOSBP53539 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOSBP53539 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOSBP53539 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOSBP53539 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOSBP53539 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOSBP53539 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FOSBP53539 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FOSBP53539 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOSBP53539 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOSBP53539 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOSBP53539 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOSBP53539 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOSBP53539 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOSBP53539 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOSBP53539 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FOSBP53539 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOSBP53539 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOSBP53539 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOSBP53539 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOSBP53539 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOSBP53539 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOSBP53539 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOSBP53539 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOSBP53539 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOSBP53539 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
FOSBP53539 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOSBP53539 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOSBP53539 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOSBP53539 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOSBP53539 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOSBP53539 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOSBP53539 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOSBP53539 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOSBP53539 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOSBP53539 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOSBP53539 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOSBP53539 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOSBP53539 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOSBP53539 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOSBP53539 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOSBP53539 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOSBP53539 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms