Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK2P51955 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK2P51955 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK2P51955 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK2P51955 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK2P51955 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK2P51955 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK2P51955 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK2P51955 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK2P51955 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK2P51955 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK2P51955 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK2P51955 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK2P51955 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK2P51955 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK2P51955 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK2P51955 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK2P51955 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK2P51955 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK2P51955 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK2P51955 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK2P51955 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK2P51955 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK2P51955 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK2P51955 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK2P51955 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK2P51955 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK2P51955 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK2P51955 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK2P51955 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK2P51955 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK2P51955 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK2P51955 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK2P51955 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK2P51955 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK2P51955 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK2P51955 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK2P51955 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK2P51955 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK2P51955 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK2P51955 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEK2P51955 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK2P51955 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK2P51955 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK2P51955 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK2P51955 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK2P51955 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK2P51955 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK2P51955 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK2P51955 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK2P51955 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK2P51955 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK2P51955 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK2P51955 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK2P51955 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK2P51955 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK2P51955 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK2P51955 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK2P51955 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK2P51955 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK2P51955 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK2P51955 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK2P51955 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK2P51955 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK2P51955 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK2P51955 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK2P51955 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK2P51955 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK2P51955 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK2P51955 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK2P51955 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK2P51955 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEK2P51955 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK2P51955 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK2P51955 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK2P51955 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK2P51955 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK2P51955 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK2P51955 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK2P51955 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK2P51955 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK2P51955 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK2P51955 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK2P51955 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK2P51955 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK2P51955 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK2P51955 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK2P51955 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK2P51955 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK2P51955 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK2P51955 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK2P51955 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK2P51955 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK2P51955 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK2P51955 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK2P51955 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK2P51955 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEK2P51955 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK2P51955 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK2P51955 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms