Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBP2P50120 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBP2P50120 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBP2P50120 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBP2P50120 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBP2P50120 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBP2P50120 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBP2P50120 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBP2P50120 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBP2P50120 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBP2P50120 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBP2P50120 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBP2P50120 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBP2P50120 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBP2P50120 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBP2P50120 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBP2P50120 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBP2P50120 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBP2P50120 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBP2P50120 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBP2P50120 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBP2P50120 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBP2P50120 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBP2P50120 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBP2P50120 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBP2P50120 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBP2P50120 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBP2P50120 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBP2P50120 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBP2P50120 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBP2P50120 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBP2P50120 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBP2P50120 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RBP2P50120 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBP2P50120 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RBP2P50120 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBP2P50120 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBP2P50120 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP2P50120 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP2P50120 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP2P50120 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP2P50120 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP2P50120 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP2P50120 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP2P50120 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP2P50120 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP2P50120 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP2P50120 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP2P50120 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP2P50120 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP2P50120 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP2P50120 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP2P50120 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP2P50120 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBP2P50120 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBP2P50120 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBP2P50120 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP2P50120 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP2P50120 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP2P50120 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP2P50120 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP2P50120 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP2P50120 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP2P50120 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP2P50120 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP2P50120 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP2P50120 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP2P50120 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP2P50120 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP2P50120 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP2P50120 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBP2P50120 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBP2P50120 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBP2P50120 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBP2P50120 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBP2P50120 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBP2P50120 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RBP2P50120 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBP2P50120 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBP2P50120 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBP2P50120 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP2P50120 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP2P50120 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP2P50120 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP2P50120 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP2P50120 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP2P50120 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP2P50120 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP2P50120 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP2P50120 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP2P50120 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP2P50120 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP2P50120 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP2P50120 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP2P50120 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP2P50120 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP2P50120 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP2P50120 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP2P50120 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP2P50120 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms