Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSK3BP49841 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSK3BP49841 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSK3BP49841 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms