Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGS4P49798 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGS4P49798 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGS4P49798 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGS4P49798 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGS4P49798 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGS4P49798 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGS4P49798 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGS4P49798 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGS4P49798 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGS4P49798 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGS4P49798 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGS4P49798 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGS4P49798 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGS4P49798 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGS4P49798 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGS4P49798 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGS4P49798 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGS4P49798 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGS4P49798 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGS4P49798 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGS4P49798 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGS4P49798 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGS4P49798 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RGS4P49798 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGS4P49798 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGS4P49798 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGS4P49798 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RGS4P49798 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGS4P49798 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGS4P49798 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGS4P49798 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGS4P49798 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGS4P49798 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGS4P49798 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGS4P49798 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGS4P49798 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGS4P49798 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGS4P49798 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGS4P49798 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGS4P49798 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGS4P49798 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGS4P49798 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGS4P49798 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGS4P49798 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGS4P49798 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGS4P49798 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGS4P49798 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGS4P49798 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGS4P49798 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGS4P49798 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGS4P49798 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGS4P49798 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGS4P49798 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RGS4P49798 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGS4P49798 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGS4P49798 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGS4P49798 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGS4P49798 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGS4P49798 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGS4P49798 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGS4P49798 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGS4P49798 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGS4P49798 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGS4P49798 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGS4P49798 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGS4P49798 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGS4P49798 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGS4P49798 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGS4P49798 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RGS4P49798 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGS4P49798 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGS4P49798 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGS4P49798 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RGS4P49798 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGS4P49798 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGS4P49798 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGS4P49798 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGS4P49798 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGS4P49798 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGS4P49798 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGS4P49798 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGS4P49798 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGS4P49798 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RGS4P49798 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGS4P49798 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGS4P49798 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGS4P49798 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGS4P49798 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGS4P49798 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGS4P49798 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGS4P49798 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RGS4P49798 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGS4P49798 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGS4P49798 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGS4P49798 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGS4P49798 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGS4P49798 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGS4P49798 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGS4P49798 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms