Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TNNI2P48788 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TNNI2P48788 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
TNNI2P48788 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNNI2P48788 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNNI2P48788 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNNI2P48788 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNNI2P48788 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNNI2P48788 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TNNI2P48788 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNNI2P48788 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNNI2P48788 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNNI2P48788 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNNI2P48788 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNNI2P48788 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNNI2P48788 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNNI2P48788 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TNNI2P48788 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms