Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRIP1P48552 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRIP1P48552 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRIP1P48552 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRIP1P48552 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRIP1P48552 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRIP1P48552 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRIP1P48552 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NRIP1P48552 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRIP1P48552 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRIP1P48552 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRIP1P48552 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRIP1P48552 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRIP1P48552 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms