Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms